Me respondo solo, Haciendo union all puedo obtener los datos de las dos tablas, pero alguien me podria explicar porque al hacerlo asi el where despues de la union no trae los datos que se le indican.
SELECT T0.[DocEntry],T0.[DocDate], T0.[FolioNum], T0.[CardName] FROM ODLN T0 WHERE T0.[DocDate] > '20151130'
UNION ALL
SELECT T0.[DocEntry],T0.[DocDate], T0.[FolioNum], T0.[CardName] FROM OWTR T0 WHERE T0.[DocDate] > '20151130'
En los datos que trae de la tabla ODLN si me arroja los que son despues de la fecha en el where, pero en los datos de la OWTR me trae casi documentos al azar.
Si me ayudaran con esto se los agradeceria